USBで接続すると、Comポートが2つ設定され、1つは無線機のコントロール。
もう1つは無線機の音声です。マイク入力とスピーカー出力はUSBに変更されます。
無線機の電源が入っている状態では、自動的に上記の状態になるので、他の音声は出なくなるのでしょうね。
FT−8等、音声を必要とするモードを使わないのであれば、音声入力と音声出力を、サウンドの設定、またはコントロールパネルのサウンドで、USBになっている所を変更してあげれば、たぶん音は出ると思うけど。
また、やったことは無いのですが、USBの音声側を無効にしても同様の結果を得られると思いますが、将来的な事を考えればお勧めしません。必要になった時に無効を忘れて必ず慌てる事になりますから。
まちがっていたら、ごめんなさい。